信息化环境下企业内部控制的转变，与网络技术息息相关。科技创新企业与传统企业相比，与网络技术、信息技术的契合度更高，因此，科技创新企业内部控制系统的构建，应从以下几点着手：
(一)转变管理思维
科技创新企业内部控制系统构建时，要以管理者为核心，自上而下彻底进行。管理者思维模式的转变势在必行，科技创新企业与传统企业有本质不同，其呈现出的高投入、高风险特征，如果没有形成有效的内部控制系统，极有可能增加企业经营风险。自上而下管理思维的转变，同时也体现在激发员工的管理积极性，使员工参与管理，参与企业内部控制的各环节，使企业内部信息传导做到高效、快捷。
(二)打造核心团队
打造核心团队应从两方面做起，一方面大力提高管理者与员工的整体素质。企业对外部人才的依赖与内部人才的培养应相辅相成，企业在不同发展阶段要有不同的人才引进、培养战略。企业初创期由于物质条件限制与自身实力薄弱吸引力差等综合原因，无法招纳高技术财务管理人员，此时的人才战略要因地制宜、因时制宜，多使用各种方面技能较为均衡的全面型人才。
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